Constantemente utilizo mapas conceituais em minhas disciplinas e normalmente recomendo as ferramentas CMapTools e Xmind para a diagramação dos mapas. Essas ferramentas são muito boas (prefiro a CMapTools), mas recentemente procurei por ferramentas disponíveis para edição online na web.
Identifiquei diversas ferramentas com propostas muitos boas, mas destaco a que comecei a utilizar, por ter um bom conjunto de funcionalidades e ser gratuita. Eu diria até mais, ela é uma ferramenta de código aberto e que, se for de interesse da instituição, pode ser disponibilizada em servidor próprio. A ferramenta em questão é a Wisemapping.
No mapa da figura abaixo eu busquei ilustrar as funcionalidades para fazer um mapa conceitual.
