Ambas as palavras se referem à fração de um número inteiro expressa em centésimos e estão corretos.
Percentagem é uma adaptação do termo em inglês percentage, ou do latim per centum.
Porcentagem é considerado um abrasileiramento surgido da locução “por cento”. Em Portugal é uma adaptação do termo em francês pourcentage.
É indicado a preferência por utilizar o termo percentagem.