Normalmente é utilizado apenas o termo entubar, mas na medicina são utilizados os dois termos para ser mais específico.
Entubar significa colocar algo dentro de um tubo.
Intubar significa colocar um tubo dentro de algo.
O termo incubar foi bastante falado durante a pandemia de COVID-19. Uma pessoa que precisava de auxílio de respirador era intubada. Nesse caso, intubar é colocar um tubo dentro da pessoa (era introduzido o tubo do respirador na pessoa). Entubar seria colocar a pessoa dentro de um tubo.